Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHQ0

Fbxo4, F-box only protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo4Q8CHQ0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo4Q8CHQ0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo4Q8CHQ0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo4Q8CHQ0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo4Q8CHQ0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo4Q8CHQ0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo4Q8CHQ0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo4Q8CHQ0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo4Q8CHQ0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo4Q8CHQ0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo4Q8CHQ0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo4Q8CHQ0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo4Q8CHQ0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo4Q8CHQ0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo4Q8CHQ0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo4Q8CHQ0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo4Q8CHQ0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo4Q8CHQ0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo4Q8CHQ0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo4Q8CHQ0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo4Q8CHQ0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo4Q8CHQ0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo4Q8CHQ0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo4Q8CHQ0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo4Q8CHQ0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fbxo4Q8CHQ0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fbxo4Q8CHQ0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fbxo4Q8CHQ0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Fbxo4Q8CHQ0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fbxo4Q8CHQ0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo4Q8CHQ0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms