Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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Usp27Q8CEG8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms