Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC5

Nkiras1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras1Q8CEC5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms