Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
A430089I19RikQ8C9W1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
A430089I19RikQ8C9W1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms