Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vwc2Q8C8N3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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