Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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