Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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