Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms