Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms