Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccser1Q8C0C4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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