Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY35

Fgd2, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd2Q8BY35 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgd2Q8BY35 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd2Q8BY35 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd2Q8BY35 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd2Q8BY35 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd2Q8BY35 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd2Q8BY35 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd2Q8BY35 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd2Q8BY35 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd2Q8BY35 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd2Q8BY35 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd2Q8BY35 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd2Q8BY35 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd2Q8BY35 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd2Q8BY35 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd2Q8BY35 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd2Q8BY35 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd2Q8BY35 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd2Q8BY35 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd2Q8BY35 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd2Q8BY35 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd2Q8BY35 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd2Q8BY35 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms