Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXX9

Ccdc169, Coiled-coil domain-containing protein 169, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc169Q8BXX9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc169Q8BXX9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc169Q8BXX9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc169Q8BXX9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms