Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Sall4Q8BX22 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms