Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms