Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PcgF3Q8BTQ0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcgF3Q8BTQ0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms