Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fbxo38Q8BMI0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms