Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG7

Rab3gap2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap2Q8BMG7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab3gap2Q8BMG7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rab3gap2Q8BMG7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rab3gap2Q8BMG7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rab3gap2Q8BMG7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab3gap2Q8BMG7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms