Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLI4

Dse, Dermatan-sulfate epimerase, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DseQ8BLI4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DseQ8BLI4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms