Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp54Q8BL06 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp54Q8BL06 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp54Q8BL06 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Usp54Q8BL06 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms