Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms