Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJN4

Fndc9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc9Q8BJN4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fndc9Q8BJN4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms