Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHW4

4933430I17Rik, RIKEN cDNA 4933430I17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933430I17RikQ8BHW4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933430I17RikQ8BHW4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms