Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH74

Nup107, Nuclear pore complex protein Nup107, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup107Q8BH74 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nup107Q8BH74 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup107Q8BH74 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup107Q8BH74 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup107Q8BH74 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup107Q8BH74 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup107Q8BH74 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup107Q8BH74 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup107Q8BH74 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup107Q8BH74 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms