Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms