Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trmt12Q8BG71 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms