Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Necab1Q8BG18 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Necab1Q8BG18 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms