Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdspl2Q8BG15 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms