Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M10.2Q85ZW9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms