Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Atg4cQ811C2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg4cQ811C2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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