Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms