Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Amigo1Q80ZD8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Amigo1Q80ZD8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Amigo1Q80ZD8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Amigo1Q80ZD8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Amigo1Q80ZD8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Amigo1Q80ZD8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Amigo1Q80ZD8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Amigo1Q80ZD8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Amigo1Q80ZD8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms