Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg2bQ80XK6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms