Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms