Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc1Q80VQ1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc1Q80VQ1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms