Protein–RNA interactions for Protein: Q80UB0

Testin-2, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q80UB0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q80UB0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q80UB0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q80UB0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q80UB0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q80UB0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q80UB0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q80UB0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q80UB0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q80UB0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q80UB0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q80UB0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q80UB0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q80UB0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q80UB0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q80UB0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q80UB0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q80UB0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q80UB0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q80UB0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q80UB0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q80UB0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q80UB0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q80UB0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q80UB0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q80UB0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q80UB0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q80UB0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q80UB0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q80UB0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q80UB0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q80UB0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q80UB0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q80UB0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q80UB0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q80UB0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q80UB0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q80UB0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q80UB0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q80UB0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q80UB0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q80UB0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q80UB0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q80UB0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q80UB0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q80UB0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q80UB0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q80UB0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q80UB0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q80UB0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q80UB0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q80UB0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q80UB0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q80UB0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q80UB0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q80UB0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q80UB0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q80UB0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q80UB0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q80UB0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q80UB0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q80UB0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q80UB0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q80UB0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q80UB0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80UB0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80UB0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80UB0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80UB0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80UB0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80UB0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80UB0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80UB0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80UB0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80UB0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80UB0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80UB0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80UB0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80UB0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80UB0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80UB0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80UB0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80UB0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80UB0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80UB0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80UB0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80UB0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80UB0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80UB0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80UB0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80UB0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80UB0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80UB0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80UB0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80UB0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80UB0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80UB0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80UB0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80UB0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80UB0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms