Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms