Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lamp3Q7TST5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms