Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSP5

Vtcn1, V-set domain containing T-cell activation inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vtcn1Q7TSP5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vtcn1Q7TSP5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vtcn1Q7TSP5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vtcn1Q7TSP5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vtcn1Q7TSP5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vtcn1Q7TSP5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vtcn1Q7TSP5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vtcn1Q7TSP5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vtcn1Q7TSP5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vtcn1Q7TSP5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vtcn1Q7TSP5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vtcn1Q7TSP5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vtcn1Q7TSP5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vtcn1Q7TSP5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms