Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClmQ7TSN2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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