Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Actn1Q7TPR4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms