Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prrc2bQ7TPM1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms