Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg4Q7TMD7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg4Q7TMD7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg4Q7TMD7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg4Q7TMD7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg4Q7TMD7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg4Q7TMD7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg4Q7TMD7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg4Q7TMD7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg4Q7TMD7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg4Q7TMD7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms