Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScocQ78YZ6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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