Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eci3Q78JN3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms