Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SpopQ6ZWS8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SpopQ6ZWS8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SpopQ6ZWS8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SpopQ6ZWS8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SpopQ6ZWS8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SpopQ6ZWS8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SpopQ6ZWS8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SpopQ6ZWS8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SpopQ6ZWS8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SpopQ6ZWS8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SpopQ6ZWS8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SpopQ6ZWS8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SpopQ6ZWS8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SpopQ6ZWS8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SpopQ6ZWS8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SpopQ6ZWS8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SpopQ6ZWS8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SpopQ6ZWS8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SpopQ6ZWS8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SpopQ6ZWS8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SpopQ6ZWS8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SpopQ6ZWS8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SpopQ6ZWS8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SpopQ6ZWS8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SpopQ6ZWS8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SpopQ6ZWS8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SpopQ6ZWS8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SpopQ6ZWS8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SpopQ6ZWS8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SpopQ6ZWS8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SpopQ6ZWS8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SpopQ6ZWS8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SpopQ6ZWS8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SpopQ6ZWS8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms