Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ncapd3Q6ZQK0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms