Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Topbp1Q6ZQF0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms