Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Usp34Q6ZQ93 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Usp34Q6ZQ93 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Usp34Q6ZQ93 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp34Q6ZQ93 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Usp34Q6ZQ93 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Usp34Q6ZQ93 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Usp34Q6ZQ93 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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