Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efr3bQ6ZQ18 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efr3bQ6ZQ18 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efr3bQ6ZQ18 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efr3bQ6ZQ18 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efr3bQ6ZQ18 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efr3bQ6ZQ18 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efr3bQ6ZQ18 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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Efr3bQ6ZQ18 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efr3bQ6ZQ18 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efr3bQ6ZQ18 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efr3bQ6ZQ18 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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Efr3bQ6ZQ18 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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Efr3bQ6ZQ18 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
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Efr3bQ6ZQ18 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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Efr3bQ6ZQ18 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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Efr3bQ6ZQ18 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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Efr3bQ6ZQ18 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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Efr3bQ6ZQ18 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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Efr3bQ6ZQ18 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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Efr3bQ6ZQ18 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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Efr3bQ6ZQ18 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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Efr3bQ6ZQ18 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms