Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NinlQ6ZQ12 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NinlQ6ZQ12 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NinlQ6ZQ12 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NinlQ6ZQ12 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NinlQ6ZQ12 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NinlQ6ZQ12 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NinlQ6ZQ12 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NinlQ6ZQ12 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NinlQ6ZQ12 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NinlQ6ZQ12 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NinlQ6ZQ12 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NinlQ6ZQ12 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NinlQ6ZQ12 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NinlQ6ZQ12 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NinlQ6ZQ12 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NinlQ6ZQ12 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NinlQ6ZQ12 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NinlQ6ZQ12 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NinlQ6ZQ12 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NinlQ6ZQ12 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NinlQ6ZQ12 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NinlQ6ZQ12 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NinlQ6ZQ12 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NinlQ6ZQ12 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NinlQ6ZQ12 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NinlQ6ZQ12 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NinlQ6ZQ12 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NinlQ6ZQ12 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NinlQ6ZQ12 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NinlQ6ZQ12 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NinlQ6ZQ12 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NinlQ6ZQ12 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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